Подлый «скрытый ген», обнаруженный в генетическом коде коронавируса, может помочь объяснить его распространение
Всемирная организация здравоохранения классифицировала COVID-19 как пандемию в марте. С тех пор вирус, похожий на грипп, распространился практически во все страны мира, заразив более 52,2 миллиона человек, унеся жизни 1,29 миллиона человек и вызвав глобальный экономический кризис и кризис в области здравоохранения.
Исследователи из Тайваня, Германии и США обнаружили, по их словам, новый, ранее неизвестный «перекрывающийся ген», скрытый в генетическом коде SARS-CoV-2.
В новом Научно-исследовательская работа на гене, который был назван ORF3d, ученые во главе с докторантом Academia Sinica / Американского музея естественной истории Чейз Нельсон объясняют, что причина того, что ген так долго оставался незамеченным, заключалась в том, что он тщательно скрыт от глаз, скрыт внутри последовательность нуклеотидов и перекрывающаяся с последовательностями других генов.
«С точки зрения размера генома SARS-CoV-2 и его родственники являются одними из самых длинных существующих РНК-вирусов», – пояснил Нельсон заявление для прессы посвященный находкам. «Таким образом, они, возможно, более подвержены« геномному обману », чем другие РНК-вирусы», – добавил он.
ORF3d – это перекрывающийся ген (OLG), то есть ген в гене. Поскольку мы привыкли предполагать, что на каждую область генома приходится один ген, OLG часто упускаются.
«Мы еще не знаем его функции и клинического значения», – продолжил Нельсон, имея в виду потенциальные «слепые пятна» искусственных фармацевтических препаратов для борьбы с вирусом, вызванным открытием. «Мы прогнозируем, что этот ген относительно маловероятно будет обнаружен с помощью Т-клеточного ответа, в отличие от ответа антител», – предположил ученый, имея в виду лейкоциты, обнаруженные в организме человека, которые помогают ему бороться с болезнями.
Нельсон и его коллеги выразили уверенность в том, что более подробное знакомство с коронавирусом может помочь «открыть новые возможности для борьбы с коронавирусом, например, с помощью антивирусных препаратов».
Кроме того, наш анализ естественного отбора SARS-CoV-2 на трех эволюционных уровнях – между таксонами, между хозяином и внутри хозяина – выявляет важные закономерности изменений. Например, фиг. 5 предполагает, что другой OLG, ORF3c, очень функционально ограничен в этом вирусе.
https://twitter.com/chasewnelson/status/1326103925376778248
По словам исследователя, на данный момент нельзя исключить, что «скрытый ген», возможно, возник как часть эволюции COVID-19, чтобы более эффективно реплицироваться, атаковать иммунную систему или способствовать передаче. Считается, что ORF3d также присутствует в ранее обнаруженном коронавирусе панголинов и вызывает сильный ответ антител у людей с положительной реакцией на коронавирус. Американский музей естественной истории указывает что ген «потенциально может кодировать белок, который длиннее, чем ожидалось случайно».
Мы также документируем доказательства трансляции ORF3d, предоставляем подробную аннотацию генома SARS-CoV-2 и многое другое. Мы надеемся, что наша статья станет полезным ресурсом для исследования этого и других генов, поскольку мы стремимся лучше понять происхождение этой пандемии.
Открытие потенциально является важным, учитывая, что SARS-CoV-2 имеет всего 15 известных генов. Говорят, что перекрывающиеся гены являются относительно обычным явлением, но, как известно, их трудно обнаружить, потому что многие компьютерные инструменты, которые ученые используют для изучения вирусов, явно не предназначены для их обнаружения.
Финансирование исследований было предоставлено грантами от Academia Sinica, тайваньской исследовательской академии, правительства штата Бавария, Германия, британской благотворительной организации, известной как National Philanthropic Trust (которая получает финансирование от законопроекта и Фонд Мелинды Гейтс), Университет Висконсин-Мэдисон и Национальный научный фонд США (который также получает поддержку от технологического миллиардера).
Выводы исследователей были опубликованы в академическом журнале с открытым доступом eLife.
Источник
В нашем Telegram‑канале вы найдёте новости о непознанном, НЛО, мистике, научных открытиях, неизвестных исторических фактах. Подписывайтесь, чтобы ничего не пропустить.
