Создана программа для скорого поиска тайн иммунитета — Ученые РАН

Русские ученые из Института биоорганической химии РАН смогут зайти в геном человека. Так работает иммунитет, но, к огромному сожалению, в нём может случится сбой, в итоге чего он «нацеливается» не на вирусы и инфекции, а на вполне здоровую часть организма, разрушая здоровые клетки, приводя к серьёзным заболеваниям.

Программу, которая дает возможность проводить анализ множества виртуальных геномов и свойств человеческой иммунной системы. Благодаря рекомбинации количество вариантов структуры рецепторов очень велико — по крайней мере, 109, а значит, велико и количество возбудителей заболеваний, которые могут распознать и обезвредить клетки иммунной системы и антитела. Программа, которую создатели назвали VDJviz наглядно представляет характеристики последовательностей рецепторов и сравнивает образцы между собой по многим параметрам расшифровки.

Результаты работы были размещены в журнале BMC Genomics. Вся совокупность способов структуры этих рецепторов называется В- либо Т-клеточным репертуаром. Ученые из Института биоорганической химии РАН поведали, как программа несомненно поможет и людям, и науке.

Основными преимуществами программы являются: поддержка форматов 6-ти самых известных инструментов для обработки данных RepSeq (MiTCR, MIGEC, MiXCR, IgBlast, IMGTHighVQuest, ImmunoSEQ), удобный графический интерфейс, наглядное представление характеристик последовательностей гипервариабельных рецепторов, возможность сравнения образцов между собой по многим параметрам, удобный экспорт приобретенных данных.